Alien: Covenant meletakkan basis pengisahannya sebelas tahun setelah deretan konflik yang terjadi dalam Prometheus. Sekelompok kru pesawat luar angkasa bernama Covenant yang awalnya berangkat dengan tujuan untuk mencapai planet Origae-6 kemudian memutuskan untuk mendarat ke sebuah planet asing setelah pesawat mereka mengalami kecelakaan. Walau awalnya merasa optimis setelah mengetahui planet asing tersebut memiliki ciri kondisi alam yang layak untuk dihuni manusia, para kru Covenant mulai mendapatkan ancaman setelah dua orang anggota mereka terinfeksi oleh material misterius. Kondisi tersebut bahkan semakin memburuk ketika makhluk-makhluk aneh mulai menyerang dan membunuh para kru pesawat luar angkasa Covenant satu per satu.
Bound for a remote planet on the far side of the galaxy, the crew of the colony ship ‘Covenant’ discovers what is thought to be an uncharted paradise, but is actually a dark, dangerous world—which has a sole inhabitant: the ‘synthetic’, David, survivor of the doomed Prometheus expedition.
